| ۱ | سه گانه های تشکیکی در عالم معرفت اسلامی | علی بابایی | مجله پژوهش های فلسفی | تابستان1399 |
| ۲ | حق تعالی تنها جوهر هستی سیر تحول جوهر و عرض بر مبنای سه مرتبهی سیر فلسفی ملاصدرا | علی بابایی | فصل نامه اندیشه دینی | تابستان 1399 |
| ۳ | بررسی تطبیقی سهگانه های حکمت اسلامی و عرفان مولوی | علی بابایی | دو فصلنامه علمی جاویدان خرد | تابستان 1397 |
| ۴ | نسبت قاعدهی «بسیطالحقیقه» و «کلالقوی بودن نفس» در حکمت صدرایی | علی بابایی_ مهدی سعادمند | فصل نامه اندیشه دینی | پاییز1398 |
| ۵ | مسئله «زمان» در سه مرتبه سیر فلسفی صدرالمتألهین | علی بابایی_ سیدمختار موسوی | معرفت فلسفی | پاییز 1400 |
| ۶ | سه مرتبه حرکت بر مبنای سه سیر فلسفی ملاصدرا: حرکت طبیعی، حرکت جوهری، تجدد امثال | علی بابایی_ سیدمختار موسوی | مجله پژوهش های فلسفی | بهار 1401 |
| ۷ | پدیداری آفرینشهای هنری بر اساس نظر نهایی در نفس شناسی صدرایی | علی بابایی_ مهدی سعادمند | آینه معرفت | بهار 1400 |
| ۸ | نقد خوانش ملاصدرا از شیخ اشراق در رابطه نور و وجود | علی بابایی | فصل نامه مطالعات معرفتی در دانشگاه اسلامی | بهار 1395 |
| ۹ | Establishing Suhrawardῑ's Ḥikmat al-Ishrāq Through Philosophical Discussion | Ali Babaei , Naser Forouhi | MUSE | Summer-Autumn 2019 |
| ۱۰ | هم سنجی قاعده بسیط الحقیقه و عبارت عرفانیِ «إن مسمی الله احدی بالذات کلٌ بالأسماء» | علی بابایی_ مهدی سعادمند | مجله علمی پژوهش های فلسفه دانشگاه تبریز | Summer 2021 |
| ۱۱ | The Boiling Circle, the Rotating Circle (Two kinds of symbols of the Circle in Islamic Tradition) | علی بابایی | wisdom | 2021 |
| ۱۲ | تعبیر «خمیره ازلی» و مساله «احیاء یا تاسیس؟» در حکمت اشراق سهروردی | علی بابایی | فصلنامه علمی تاریخ فلسفه | 1399/04/08 |
| ۱۳ | فهم رابطه خدا با عالم از روی مَثَل در حکمت اسلامی با تأکید بر دیدگاه صدرا | علی بابایی | پژوهشگاه فرهنگ و اندیشه اسلامی | 1397 |
| ۱۴ | جایگاه وجودی قلب در نفس شناسی ملاصدرا | علی بابایی | مطالعات معرفتی در دانشگاه اسلامی | 1396/08/01 |
| ۱۵ | نفس نور است یا وجود؟ | علی بابایی، قاسم پورحسن | خردنامه | 1394/06/30 |
| ۱۶ | موضوعات علم بر مبنای سه سیر فلسفی | علی بابایی | جستارهایی در فلسفه و کلام | 1/6/1402 |
| ۱۷ | تحول تجرید ادراکی در سه سیر فلسفی | مهدی سعادتمند، علی بابایی | فلسفه و کلام | 1/6/1402 |
| ۱۸ | وفای مشکک در عرفان مولانا | علی بابایی | مطالعات عرفانی | 1/10/1401 |