برنامه درسی

 فصل اول: اهمیت مطالعه مکانیسم عمل آنزیمها

 فصل دوم: روشهای مختلف و کلی شیمی آنزیمها شامل: مجاورسازی، جهت دهی، تغییرات کووالان

 فصل سوم: مکانیسم عمل آنزیمها: روشهای اسید باز، مکانیسم الکترواستاتیک، حمله گروههای نکلوفیلی و الکتروفیلی

 فصل چهارم: روشهای مورد استفاده در تعیین مکانیسم عمل آنزیمها: ابزارهای سیننتیکی و استفاده از مواد نشاندار، استفاده از مهار کنندگان برگشت پذیر و استفاده از فنون متنوع اسپکتروسکوپی

 فصل پنجم: ابزارهای سیننتیکی آنزیمها، مفهوم کاینتیک ایزوتوپ افکت (Kinetic isotope effect) و استفاده از ترکیبات رادیواکتیو در مطالعات آنزیمی

 فصل ششم: استفاده از مهار کننده­های برگشت پذیر در تعیین مکانیسم عمل آنزیمها: استیل کولین استراز به عنوان مدل مطالعه

 فصل هفتم: مکانیسم عمل کربن نیتروژن لیازها: مکانیسم عمل آسپارتاز و میتیل آسپارتاز

 فصل هشتم: ایزمرازها: 1/1-Hydrogen shift، پرولین راسماز و هیدروکسی پرولین اپیمراز، سنتز گرامسیدین و آنزیم فنیل آلانین راسماز

 فصل نهم: 1/1-Hydrogen shift، متیل مالونیل کوآ راسماز، ماندلات راسماز، ریبولوز ۵- فسفات ۴- اپیمراز و لاکتات راسماز

 فصل دهم: 1/2-Hydrogen shift، آلدوزکتوز ایزومرازها، فسفر گلوکز ایزومراز، و فسفومانوز ایزومراز

 فصل یازدهم: 1/2-Hydrogen shift، مکانیسم عمل تریوز فسفات ایزومراز

 فصل دوازدهم: 1/3-Hydrogen shift، مکانیسم آلیلیک ایزومریزاسیون، استروئید ایزومراز، وینیل استیل کوآ ایزومراز

 فصل سیزدهم: 1/3-Hydrogen shift، مکانیسم عمل ایزو پنتنیل پیروفسفات ایزومراز و بتاهیدروکسی دکانوئل تیواستر دهیدراز و مهار کنندههای این گروه از آنزیمها

 جلسه چهاردهم: مکانیسم عمل نوآراییهای درون مولکولی، مهاجرت آلکیل، مکانیسم عمل آنزیمهای استوهیدروکسی اسید ایزومروردوکتاز، مکانیسم حلقوی شدن اسکوالن به لانسترول، و سنتز کلسترول

 جلسه پانزدهم: نوآرایی درون مولکولی کریزمات با آنزیم: مکانیسم سنتز آمینو اسیدهای آروماتیک، آنتونیلات و پارا آمینو بنزوات از کوریزمات

 جلسه شانزدهم: سمینارهای دانشجویی و مباحث آزاد

اهداف کلی درس: آشنایی با فنون مورد نیاز و چگونگی مطالعه مکانیسم عمل آنزیمها و تفسیر نتایج حاصل از مطالعات با ذکر مثالهای متعدد با هدف توانمندی در طراحی داروها حشره کشها و مواد دیگر با ارزش صنعتی است

 جلسه ششم: اصول طبقه ­بندی آنزیمها بر اساس نوع واکنش با مثالهای معتبر

جلسه هفتم: نامگذاری و طبقه­بندی آنزیمها، پایگاههای علمی معتبر و روشهای مرسوم نامگذاری آنزیمها

 جلسه هشتم: سینتیک آنزیمهای تک سوبسترایی، مکانیسمهای تعادل سریع و حالت پایدار

 جلسه نهم: مدل میکائیلیس-منتن؛ روشهای خطی کردن نمودارهای فعالیت آنزیمی

 جلسه دهم: مکانیسمهای مهار واکنشهای آنزیمی و اهمیت کاربردی آنها

  جلسه یازدهم: بررسی جایگاه فعال آنزیم (تغییرات غلظت پیش ماده، تغییرات ساختار پیش ماده، تغییرات pH و .. )

 جلسه دوازدهم: روشهای تثبیت آنزیمها و سلولها و کاربرد تثبیت بیوکاتالیست ها

 جلسه سیزدهم: کاربرد آنزیمها در پزشکی و تشخیص

 جلسه چهاردهم: کاربرد آنزیمها در صنعت

 جلسه پانزدهم: آنزیم های مصنوعی و نانوزیم ها

جلسه شانزدهم: سمینارهای دانشجویی و مباحث آزاد

هدف درس: آشنایی دانشجویان با مفاهیم پایه آنزیم شناسی تنظیم فعالیت آنزیمها مکانیسم مهار آنزیمها روشهای سنجش فعالیت آنزیمی و نیز کاربرد آنزیمها در صنایع و پزشکی و تشخیصی

جلسه اول: مقدمه­ای بر هورمون شناسی و غدد ترشحی

 جلسه دوم: هورمونهای غده هیپوتوناموس و نقش آنها در تنظیم فعالیت غدد درون ریز پایین دست

 جلسه سوم: ساختار و عمل هورمونهای هیپوفیز

 جلسه چهارم: غده تیروئید ساختار سلولی و نحوه سنتز و ترشح هورمونهای تیروئیدی

 جلسه پنجم: ادامه عملکرد غده تیروئید و غده پاراتیروئید

 جلسه ششم: ساختار و عملکرد ترشحی غده پانکراس

 جلسه هفتم: هورمونهای دستگاه گوارش معده

 جلسه هشتم: هورمونهای دستگاه گوارش روده کوچک نقش آنها در متابولیسم بدن

 جلسه هفتم: هورمونهای کبد کلیه و قلب

 جلسه هشتم: هورمونهای غده آدرنال

 جلسه نهم: هورمونهای غدد جنسی در مردان و زنان

 جلسه دهم: تنظیم هورمونهای جنسی در زنان یائسگی قاعدگی

 جلسه یازدهم: پروستاگلندینها لوکوتینها و پروستاسایکلین

 جلسه دوازدهم: هورمون و سرطان

 جلسه سیزدهم: گیرندههای هورمونی سطح سلولی ساختار و عملکرد آنها

جلسه چهاردهم: گیرندههای هورمونی سطح سلولی ساختار و عملکرد آنها-ادامه

 جلسه پانزدهم: گیرندههای هورمونی داخل سلولی و داخل هسته ساختار و عمل

جلسه شانزدهم: سمینار کلاسی دانشجویان

اهداف کلی درس: آشنایی با هورمونهای بدن، بیوسنتز، مکانیسم عمل و بیماریهای مرتبط با هورمونها، و تنظیم ترشح آنها.

جلسه اول: انرژتیک و متابولیسم آنابولیسم کاتابولیسم و متابولیسم حد واسط

 جلسه دوم: جریان انرژی در طبیعت و نقش اکسیداسیون و احیا در آن

 جلسه سوم: مکانیسمهای مهم درگیر در تنظیم متابولیسم (سطوح تنظیمی از ژن تا پروتئین)

 جلسه چهارم: تنظیم متابولیسم کربوهیدراتها، لیپیدها، اسیدهای آمینه و پروتئینها

جلسه پنجم: هضم و جذب مواد غذایی در سیستم گوارشی

 جلسه ششم: متابولیسم ویژه ارگانها و بافتها- متابولیسم سلولهای کبدی و نقش کبد در تنظیم اولیه متابولیسم

 جلسه هفتم: متابولیسم ویژه ارگانها و بافتها- متابولیسم مغز و عضلات اسکلتی

 جلسه هشتم: متابولیسم ویژه ارگانها و بافتها- متابولیسم بافت چربی کلیه و ارگانهای حسی

 جلسه نهم: متابولیسم ویژه سلولها (گلبولهای قرمز سلولهای اندوتیلیال ماکروفاژها لنفوسیتها و ...)

 جلسه دهم: ارگانهای درون ریز و هورمونها در تنظیم متابولیسم (پانکراس، هیپوفیز، تیروئید، فوق کلیه، چربی و روده)

 جلسه یازدهم: تنظیم هماهنگ متابولیسم (یکپارچگی متابولیسمی)

 جلسه دوازدهم: اصول مطالعات متابولومیک

 جلسه سیزدهم: تنظیم متابولیسم در شرایط خاص (تمرینات ورزشی و ....)

 جلسه چهاردهم: متابولیسم سلولهای سرطانی

 جلسه پانزدهم: بیماریهای متابولیکی و روشهای تشخیص و درمان آنها- دیابت و ..

 جلسه شانزدهم: سمینار کلاسی دانشجویان

 اهداف کلی درس فراگیری اصول بیوینرژیتیک و مسیرهای کاتابولیک و آناولیک و تنظیم این مسیرها در سیستمهای هوازی و غیر هوازی

جلسه اول: مقدمه و اصول بیو انرژیتیک

 جلسه دوم: مروری بر متابولیسم ها و زنجیره انتقال الکترون

 جلسه سوم: آمینو اسیدها- ترنس آمیناسیون دآمیناسیون

 جلسه چهارم: متابولیسم آمینو اسیدها چرخه اوره

جلسه پنجم: متابولیسم آمینو اسیدها چرخه اوره-ادامه

 جلسه پنجم: تجزیه آمینو اسیدها و بیماریهای متابولیکی مربوط به آنها

 جلسه ششم: تجزیه آمینو اسیدها و بیماریهای متابولیکی مربوط به آنها

جلسه هفتم: آنابولسیم و کاتابولیسم نوکلئوتیدها

جلسه هشتم: متابولیسم نوکلئوتیدهای پورینی

جلسه نهم: متابولیسم نوکلئوتیدهای پریمیدینی

جلسه نهم: بیماریهای مربوط به متابولیسم نوکلئوتیدها

جلسه یازدهم: سمینارهای دانشجویی

هدف این درس آشنایی دانشجویان دوره کارشناسی رشته زیست شناسی با مسیرهای بیوشیمیایی سنتز و تجزیه ماکرو مولکولهای مختلف موجود در سیستمهای زنده است.

جلسه هشتم: مقدمهای بر استخراج ماکرومولکولهای زیستی

 جلسه نهم: روشهای استخراج و تهیه نمونه­های زیستی برای جداسازی ماکرومولکولهای از منابع مختلف

  جلسه دهم: خالص سازی مواد استخراجی به وسیله کروماتوگرافی- اصول  و مبانی کروماتوگرافی

 جلسه یازدهم: انواع کروموگرافی ستونی و صفحه­ای: ژل فیلتراسیون، هیدروفوبی، تمایلی، کروماتوفکوسینگ

 جلسه دوازدهم: تئوری صفحات کروماتوگرافی و تئوری سرعت کروماتوگرافی-معادلات وان دیمتر

 جلسه سیزدهم: کروماتوگرافی گازی و کاربرد آن در مطالعات بیوشیمیایی

 جلسه چهاردهم: آشنایی با مفاهیم پایه اسپکتروسکوپی: ترازهای الکترونی، ترازهای ارتعاشی، بر همکنش امواج الکترومغناطیسی و الکترونها در اربیتالهای مولکولی، انواع برهمکنش نور با ماده

 جلسه پانزدهم: اسپکتروسکوپی جذبی مرئی فرابنفش و کاربرد آن در مطالعات بیوشیمیایی

 جلسه شانزدهم: اصول و مبانی اسپکتروسکوپی نشری و کاربرد آن در مطالعات بیوشیمیایی

اهداف کلی درس: آشنایی دانشجویان با روشهای رایج بیوشیمی در جهت تخلیص و شناسایی ماکرومولهای زیستی، آشنایی دانشجویان با مبانی روشهای رایج اسپکتروسکوپی مورد استفاده در بیوشیمی و کاربرد آنها در مطالعات علوم حیاتی

 جلسه اول: مقدمه­ای بر ساختار پروتئینها و آنزیمها

 جلسه دوم: ویژگی واکنشهای آنزیمی و مکانیسم تسریع واکنشهای شیمیایی توسط آنزیمها

 جلسه سوم: نامگذاری و طبقه­ بندی آنزیمها، پایگاههای علمی معتبر و روشهای مرسوم نامگذاری آنزیمها

 جلسه چهارم: اصول طبقه ­بندی آنزیمها بر اساس نوع واکنش با مثالهای معتبر

 جلسه پنجم: کوفاکتورها و کوآنزیمها و نقش آنها در واکنشهای کاتالیز آنزیمی

جلسه ششم: روشهای اندازه ­گیری فعالیتهای آنزیمی

 جلسه هفتم: آنزیمهای ساده و آلوستریک

 جلسه هشتم: سینتیک آنزیمهای تک سوبسترایی، مکانیسمهای تعادل سریع و حالت پایدار

 جلسه نهم: مدل میکائیلیس-منتن؛ روشهای خطی کردن نمودارهای فعالیت آنزیمی

 جلسه دهم: مکانیسمهای مهار واکنشهای آنزیمی و اهمیت کاربردی آنها

  جلسه یازدهم: بررسی جایگاه فعال آنزیم (تغییرات غلظت پیش ماده، تغییرات ساختار پیش ماده، تغییرات pH و .. )

 جلسه دوازدهم: روشهای تثبیت آنزیمها و سلولها و کاربرد تثبیت بیوکاتالیست ها

 جلسه سیزدهم: کاربرد آنزیمها در پزشکی و تشخیص

 جلسه چهاردهم: کاربرد آنزیمها در صنعت

 جلسه پانزدهم: آنزیم های مصنوعی و نانوزیم ها

جلسه شانزدهم: سمینارهای دانشجویی و مباحث آزاد

هدف درس: آشنایی دانشجویان با مفاهیم پایه آنزیم شناسی، تنظیم فعالیت آنزیمها، مکانیسم مهار آنزیمها، روشهای سنجش فعالیت آنزیمی و نیز کاربرد آنزیمها در صنایع و پزشکی و تشخیصی

جلسه اول: انرژتیک و متابولیسم آنابولیسم کاتابولیسم و متابولیسم حد واسط

 جلسه دوم: جریان انرژی در طبیعت و نقش اکسیداسیون و احیا در آن

 جلسه سوم: مکانیسمهای مهم درگیر در تنظیم متابولیسم (سطوح تنظیمی از ژن تا پروتئین)

 جلسه چهارم: تنظیم متابولیسم کربوهیدراتها، لیپیدها، اسیدهای آمینه و پروتئینها

جلسه پنجم: هضم و جذب مواد غذایی در سیستم گوارشی

 جلسه ششم: متابولیسم ویژه ارگانها و بافتها- متابولیسم سلولهای کبدی و نقش کبد در تنظیم اولیه متابولیسم

 جلسه هفتم: متابولیسم ویژه ارگانها و بافتها- متابولیسم مغز و عضلات اسکلتی

 جلسه هشتم: متابولیسم ویژه ارگانها و بافتها- متابولیسم بافت چربی کلیه و ارگانهای حسی

 جلسه نهم: متابولیسم ویژه سلولها (گلبولهای قرمز سلولهای اندوتیلیال ماکروفاژها لنفوسیتها و ...)

 جلسه دهم: ارگانهای درون ریز و هورمونها در تنظیم متابولیسم (پانکراس، هیپوفیز، تیروئید، فوق کلیه، چربی و روده)

 جلسه یازدهم: تنظیم هماهنگ متابولیسم (یکپارچگی متابولیسمی)

 جلسه دوازدهم: اصول مطالعات متابولومیک

 جلسه سیزدهم: تنظیم متابولیسم در شرایط خاص (تمرینات ورزشی و ....)

 جلسه چهاردهم: متابولیسم سلولهای سرطانی

 جلسه پانزدهم: بیماریهای متابولیکی و روشهای تشخیص و درمان آنها- دیابت و ..

 جلسه شانزدهم: سمینار کلاسی دانشجویان

اهداف کلی درس: فراگیری اصول بیوانرژتیک و مسیرهای کاتابولیک و آنابولیک و تنظیم این مسیرها در سیستمهای هوازی و غیر هوازی