برنامه درسی

لیست برنامه های درسی

عنوان بیولوژی ساختگی
مقطع تحصیلی دكتری تخصصی PhD
زمان برگزاری یکشنبه 14-16
مکان برگزاری دانشکده کشاورزی - اتاق مدیر گروه
تعداد واحد ۲
پیش نیاز درس

مهندسی ژنتیک پیشرفته

زمان بندی و نحوه ارائه درس

یکشنبه ها ساعت 14 - 16

طرح درس

مطالب ارایه شده برای شانزده جلسه بترتیب:

1- تعاریف بیولوژی ساختگی

2- تاریخچه بیولوژی ساختگی

3- ابزارهای بیولوژیکی 

4- ریبوریگولاتورها

5- بیولوژی سیستم ها 

6- مهندسی زیستی

7- مهندسی مسیرهای متابولیکی جدید

8-  مهندسی مسیرهای متابولیکی جدید (ادامه)

9- ویرایش ژنوم 

10- حسگرهای زیستی

11- ژنومیک مصنوعی 

12- ژنوم شناسی

13- پروتوسل

14- طراحی مولکولهای بیولوژیک غیر طبیعی

15- بیولوژی این سیلیگو

16- چشم انداز و مخاطرات

عنوان مهندسی ژنتیک
مقطع تحصیلی کارشناسی ارشد
زمان برگزاری شنبه و دوشنبه 10-12
مکان برگزاری دانشکده کشاورزی - اتاق مدیر گروه و آزمایشگاه مهندسی ژنتیک ساختمان شماره 2
تعداد واحد ۳
زمان بندی و نحوه ارائه درس

نظری (دوشنبه ها ساعت 10 - 12 )

 عملی( آزمایشگاه مهندسی ژنتیک ساختمان شماره 2 -  سه روز پایان ترم)

طرح درس

مباحث 50 درصد از دو واحد نظری  از جلسه اول تا هشتم:

1- تاریخچه و تعریف،  ابزار لازم برای دستورزی ژنتیکی

2- انواع آنزیم های برشی، سایر آنزیمهای مهم در مهندسی ژنتیک و تهیه DNA  اینسرت

3- ناقلین (تعریف ناقل ، عملکرد ، انواع ناقل، پلاسمیدها و فاژها و غیره...)

4- روشهای همسانه سازی 

5- ساخت کتابخانه cDNA، روشهای جداسازی ژن و روشهای غربالگری کتابخانه cDNA

6- ساخت یک وکتور نوترکیب (پیشبر ، ژن اصلی ، ژن مارکر و وکتور مناسب)

7- واکنش زنجیره ای پلیمراز و انواع آن

8- تایید وکتور نوترکیب (PCR, برش آنزیمی و توالی یابی)

 

مباحث 50 درصد از یک واحد عملی : (عملیات این درس بمدت سه روز کامل و پیوسته در آزمایشگاه انجام میگیرد)

1- تهیه انواع محیط کشت باکتری 

2- تهیه سلول های مستعد باکتریایی و ترانسفورماسین باکتریایی

3- استخراج پلاسمید 

4- برش آنزیمی

5- الکتروفورز پلاسمید استخراجی

6- برش ژل آگارز و تخلیص DNA 

عنوان مبانی مهندسی ژنتیک و انتقال ژن
مقطع تحصیلی کارشناسی
زمان برگزاری چهرشنبه 10 -12 و شنبه 2-4
مکان برگزاری دانشکده کشاورزی
تعداد واحد ۳
پیش نیاز درس

به نژادی گیاهان زراعی

زمان بندی و نحوه ارائه درس

چهارشنبه ها و شنبه ها

طرح درس

جلسه یک تا دوازده برای درس مشترک سه واحدی بترتیب :

  1. مقدمه ای بر انتقال ژن
  2. کاربرد مهندسی ژنتیک در به­نژادی گیاهی
  3. کاربرد مهندسی ژنتیک در به­نژادی گیاهی - ادامه
  4. اهداف انتقال ژن در گیاهان
  5. مکانیسم های انتقال ژن به باکتری ها
  6. آنزیمهای مهم در مهندسی ژنتیک
  7. آنزیمهای مهم در مهندسی ژنتیک - ادامه
  8. روشهای مختلف همسانه سازی
  9. روشهای مختلف همسانه سازی - ادامه
  10. انواع ناقل های همسانه سازی
  11. آشنایی با مفهوم کتابخانه های ژنی
  12. آشنایی با مفهوم کتابخانه های ژنی

هدف از طرح درس

آشنایی با اصول و مبانی همسانه سازی ژنها

عنوان فن آوریهای نوین در کشاورزی
مقطع تحصیلی کارشناسی
زمان برگزاری یکشنبه 10-12
مکان برگزاری دانشکده کشاورزی کلاس 8
تعداد واحد ۲
پیش نیاز درس

مبانی بیوتکنولوژی گیاهی

زمان بندی و نحوه ارائه درس

روزهای یکشنبه ساعت 10 تا 12

طرح درس

برنامه درسی شش جلسه  از درس مشترک سه استادی دو واحدی  فناوریهای مدرن در تولید گیاهان زراعی

جلسه اول – مقدمه، اهمیت فناوری های نوین در قرن 21

جلسه دوم – گیاهان تراریخته  (Transgenic crops)

جلسه سوم – گیاهانن تراریخته –  (Transgenic crops) - ادامه

جلسه چهارم – بذرهای مصنوعی (Synthetic seeds)

جلسه پنجم  - جنین زایی در گیاهان (Plant embryogenesis)

جلسه ششم – زیست شناسی مصنوعی ( Synthetic biology)

هدف از طرح درس

آشنایی دانشجویان با فناوری های نوین و استفاده از آنها در علوم زراعی

عنوان مهندسی ژنتیک پیشرفته
مقطع تحصیلی دكتری تخصصی PhD
زمان برگزاری یکشنبه 8-10
مکان برگزاری دانشکده کشاورزی - اتاق مدیر گروه
تعداد واحد ۲
پیش نیاز درس

ندارد

زمان بندی و نحوه ارائه درس

یکشنبه ها ساعت 8 - 10

طرح درس

16 جلسه بشرح:

1- شناسایی ژن ها و جداسازی آن ها

2- روشهای شناسایی ژن مبتنی بر هیبریداسیون نظیر بلاتینگ و استفاده از کتابخانه های ژنومی و cDNA

3- انواع روش های تهیه شناساگر و روشهای نوین توالی یابی

4- روشهای شناسایی مبتنی بر عملکرد ژن، واکنش ایمنولوژیکی، میانکنش شیمیایی پروتئین ها (نظیر سیستم هیبرید مخمردوتایی و نمایش فاژ )  

5 - سنتز ژن، شناسایی عملکرد ژنها

6- خاموشی ژنها و غیر فعال سازی کامل (نوترکیبی همولوگوس و ترانسپوزان)، بکار گیری dsRNA

7-  القای موتاسیون هدفدار در جایگاه خاص و انواع روشهای آن

8- شناسایی عملکرد ژنوم (ترانسکریپتوم شامل میکرواری و RNAseq , SAGE و پروتئوم شامل پروتئومیکس)

9-  مهندسی تنظیم کننده ها (Regulon engineering) و بیوسنسورها

10-  ساخت یک سازه مناسب برای انتقال به گیاهان از طریق آنزیمهای برشی و مبتنی و غیر مبتنی بر PCR ، وابسته به لیگاز و غیر وابسته به لیگاز، Golden gate  و  Golden Braied

11- بکارگیری دستورزی ژنتیکی در مهندسی پروتئین ( روش Rational و Evolutional )

12- بیان پروتئین هترولوگوس در میزبانهای پرو و یوکاریوت

13- سیستم های خالص سازی پروتئین های نوترکیب

14- انواع انتقال ژن به گیاهان (دایمی ، موقت شامل روشهای Cisgenesis, transgenesis, transplastomics genome editting, Inplanta transformation)

15- اهداف مهندسی ژنتیک گیاهی (مقاومت به تنش های زیستی و غیرزیستی ، زیست پالایی ، کیفیت مواد غذایی و ...)

16- موقعیت مهندسی ژنتیک و محصولات تراریخته در ایران و جهان

 

عنوان ژنتیک میکروبها
مقطع تحصیلی کارشناسی ارشد
زمان برگزاری دوشنبه 10-12
مکان برگزاری دانشکده کشاورزی - اتاق مدیر گروه
تعداد واحد ۲
زمان بندی و نحوه ارائه درس

دوشنبه ها - ساعت 10 تا 12

طرح درس

مباحث 16 جلسه درس دو واحدی بشرح زیر می باشد:

1- اسیدهای نوکلئیک شامل سا ختار و تکثیر و ترمیم

2- بیان ژنها شامل رونویسی و ترجمه و تغییرات بعد از ترجمه

3-  بیان شامل رونویسی و ترجمه و تغییرات بعد از ترجمه (ادامه)

4- تنوع : انواع موتاسیون، نوترکیبی، جداسازی موتانت ها

5- تنظیم بیان ژن، تعداد کپی ژن ، پیشبرها و عناصر تنظیمی

6- تنظیم بیان ژن در سطح ترجمه ، اتصال به ریبوزوم ، کاربرد کدونی، 

7- ژنتیک باکتریوفاژها: ساختار ، انواع ،  نوترکیبی

8- پلاسمیدها و انواع آن، خصوصیات مولکولی پلاسمیدها و ارتباط آن با فنوتیپ 

9- انتقاال ژن به باکتری و ژنوم پلاستیسیتی

10- مهنذدسی ژنتیکی باکتریها

11- مسیرهای متابوایکی و موتاسیون زایی هدفمند

12- ژنوم و ژنومیک باکتریها

13- ژنتیک ویروس ها ، ساختار فیزیکی و رده بندی ویروسها

14- ژنوم ویروس ها در مقایسه با پروکاریوتها و یوکاریوتها

15- ژنوم ویروس ها و سازماندهی آن، 

16- مکانیسم بیان ژنها و استراتژی های  تکثیر در ویروس ها

عنوان مبانی بیوتک گیاهی
مقطع تحصیلی کارشناسی
زمان برگزاری چهارشنبه 8-12
مکان برگزاری دانشکده کشاورزی کلاس 8 و 11
تعداد واحد ۳
پیش نیاز درس

دروس ژنتیک و مبانی به نژادی گیاهی

زمان بندی و نحوه ارائه درس

هر هفته روزهای چهارشنبه 8 - 10 

یک هفته در میان چهارشنبه 10 - 12

طرح درس

بترتیب برنامه درسی به تفکیک جلسه 1 تا 24

  1. تعریف بیوتکنولوژِی و مهندسی ژنتیک
  2. تاریخچه بیوتکنولوژی و جایگاه آن
  3. تقسیم بندی بیوتکنولوژی
  4. اهمیت و کاربرد بیوتکنولوژی در اصلاح نباتات
  5. کشت بافت و کاربردهای آن در بیوتکنولوژی 
  6. کشت بافت و کاربردهای آن در بیوتکنولوژی - ادامه
  7. کشت بافت و کاربردهای آن در بیوتکنولوژی - ادامه
  8. کشت بافت و کاربردهای آن در بیوتکنولوژی - ادامه
  9. کشت بافت و کاربردهای آن در بیوتکنولوژی - ادامه
  10. مهندسی ژنتیک (اصول تکنولوژی DNA نوترکیب)
  11. مهندسی ژنتیک (انواع وکتورها)
  12. مهندسی ژنتیک (ادامه انواع وکتورها)
  13. مهندسی ژنتیک (روش های کلون کردن DNA )
  14. مهندسی ژنتیک (استفاده از تکنیک PCR)
  15. مهندسی ژنتیک (ادامه استفاده از تکنیک PCR)
  16. مهندسی ژنتیک (همسانه سازی با استفاده از پلاسمیدها)
  17. نشانگرهای مولکولی (پروتئینی - DNA)
  18. کاربرد نشانگرهای مولکولی در اصلاح نباتات
  19. روش های انتقال ژن
  20. روش های انتقال ژن (ادامه)
  21. روش های انتقال ژن (ادامه)
  22. بررسی و ارزیابی گیاهان تراریخته
  23. بررسی و ارزیابی گیاهان تراریخته - ادامه
  24. نگرانی های مرتبط با گباهان تراریخته (احتماعی ، اخلاقی و اقتصادی)

هدف از طرح درس

آشنایی دانشجویان با مباحث اصلاحی نوین و زیست فناوری گیاهی خصوصا مهندسی ژنتیک

عنوان بیوشیمی پیشرفته
مقطع تحصیلی کارشناسی ارشد
زمان برگزاری شنبه 10-12
مکان برگزاری دانشکده کشاورزی - اتاق مدیر گروه
تعداد واحد ۲
زمان بندی و نحوه ارائه درس

شنبه ها ساعت 10 - 12

طرح درس

مباحث جلسات هشتگانه از درس دو واحدی  بیوشیمی پیشرفته

1- بیوشیمی پیشرفته و جایگاه آن در بیوتکنولوژی

2- مروری بر ساختار سلولی و بیومولکولها 

3- روش های استخراج و تخلیص پروتئین 

4- سانتریفیوژ و رسوب دهی انتخابی و دیالیز پروتئین ها

5- آشنایی با روشهای کروماتوگرافی و اسپکترومتری

6- اصول الکتروفورز پروتین ها و انواع آنها

7- روش های تعیین مقدار و فعالیت ویژه 

8- الایزا و انواع آن

9- انواع DNA , RNA غیر معمول و کاربرد آنها در بیوتکنولوژی